De retour le 4 septembre 1838 du Second voyage en zigzag qu'il a effectué avec ses élèves, Rodolphe Tpffer va demeurer seul à la tête de son pensionnat car sa femme, sa chère Kity, se remet à Mornex de la mort de son père. Quotidiennement, Rodolphe la tiendra au courant de ce qui se passe chez lui et en ville : Genève est alors, comme le reste de la Suisse, très préoccupée parce que la France réclame, avec menaces de guerre à l'appui, la présence sur son sol du prince Louis Napoléon Bonaparte, établi dans le canton de Thurgovie dont il a pris la nationalité. Cette affaire sera réglée par le départ volontaire du futur Napoléon III. Les lettres de Rodolphe Tpffer sont alors consacrées à des événements plus personnels dont certains furent d'importance : les fameuses cinq Lettres vertes, attribuées par lui à la plume d'Albert Rilliet-de Candolle qu'il n'aimait pas, sont dirigées contre l'Académie dont Tpffer devient l'ardent défenseur. Par ailleurs il se plaint des contrefaçons parisiennes des histoires de MM. Jabot, Crépin et Vieux-Bois, il fait paraître divers articles dans la Bibliothèque universelle de Genève, rédige ses récits de voyages, édite les histoires de MM. Pencil et Festus, et publie son recueil des Nouvelles et mélanges. En plus de cette intense activité, Rodolphe Tpffer correspond avec Xavier de Maistre qui le mettra en rapport avec le grand critique français Sainte-Beuve, ce qui aura pour futur résultat l'édition à Paris des Nouvelles genevoises. Rodolphe Tpffer, même s'il est parfois d'humeur noire, n'a rien perdu de son humour ce qu'attestent ses lettres parfois caustiques adressées à ses amis David Munier et Auguste De la Rive.

Biographes comme admirateurs de l'écrivain genevois Rodolphe Tpffer (1799-1846) souhaitaient que sa correspondance fût éditée. Quiconque avait pu, en effet, consulter ses lettres déposées à la Bibliothèque publique et universitaire de Genève y retrouvait l'humour de l'auteur des Histoires en estampes dont les héros sont, entre autres, Jabot, Crépin, Vieux-Bois et Festus , le charme des Nouvelles genevoises, la spontanéité de l'écriture et des dessins des Voyages en zigzag. Jacques Droin, ancien magistrat, président pendant deux décennies de la Société d'études tpffériennes de Genève, s'est attelé à la tâche de transcrire et d'annoter les quelque mille cinq cents lettres que nous a laissées Tpffer. L'édition qui en ressort fera connaître le caractère attachant d'un écrivain de la première moitié du XIXe siècle, qui fut à la fois professeur des traditions genevoises et chef de pensionnat, un dessinateur humoristique à l'origine d'un genre nouveau, auquel la bande dessinée est redevable, un critique d'art et l'initiateur de la peinture alpestre helvétique. Ce premier tome contient les lettres que Rodolphe échangea avec sa famille et avec ses proches durant son séjour parisien, au cours duquel il devait renoncer à sa vocation de peintre, héritée de son père Adam-Wolfgang Tpffer, en raison d'une faiblesse de la vue pour finalement embrasser la carrière de professeur.

Le deuxième volume de la Correspondance complète de Rodolphe Tpffer reproduit les lettres écrites ou reçues par lui entre son retour à Genève en juillet 1820, au terme d'un long séjour à Paris, et sa nomination le 17 octobre 1832 comme professeur de rhétorique à l'Académie de Genève. Au cours de ces douze années de nombreux événements surviendront qui seront décisifs pour son avenir et sa réputation. Après avoir perfectionné sa connaissance des langues anciennes, il sera engagé en qualité de sous-maître dans le pensionnat du pasteur Jean Heyer, et, tout en surveillant ses élèves, il enverra à sa fiancée Kity Moulinié d'extraordinaires missives, rédigées dans des styles divers, destinées à engager celle-ci à l'aimer et à l'épouser. Le mariage conclu en novembre 1823, Rodolphe se brouille avec le pasteur Heyer, et, l'année suivante, ouvre son propre pensionnat sur la promenade Saint-Antoine. Pour établir sa réputation d'instituteur sérieux, il édite avec un ami les Harangues politiques de Démosthène. Ce qui ne l'empêche pas de composer pour le cercle de ses élèves et de leurs parents les Albums en estampes (les histoires de MM. Jabot, Festus, Crépin, Cryptogame), les récits des Voyages annuels du pensionnat ainsi que des pièces de théâtre, de rédiger la critique des expositions de peinture ouvertes à Genève et d'écrire sa première nouvelle, la Bibliothèque de mon oncle. Tpffer enverra Cryptogame et Festus à son ami Frédéric Soret de Weimar, qui les soumettra à Goethe quelques semaines avant sa mort. Et c'est l'appréciation admirative de Goethe qui encouragera Rodolphe à les publier enfin.

Rodolphe Tpffer est nommé en octobre 1832 professeur de rhétorique à l'Académie de Genève. Il devient ainsi un notable dans la République, et côtoie désormais ses amis George Maurice, David Munier et Abraham Pascalis, qui l'ont précédé dans leurs chaires respectives. Ce troisième volume de la «Correspondance complète» contient les lettres pleines d'humour (et parfois de méchancetés sur quelques collègues) qu'il adresse à son cher ami David Munier, ainsi qu'à Auguste de La Rive, professeur de physique, avec lequel il se liera peu à peu d'une amitié profonde. Durant les années 1833 à 1838, Tpffer ne sera pas qu'un directeur de pensionnat et un professeur d'Académie. Il devient aussi un auteur, et les diverses Nouvelles qu'il publie (la plupart dans la «Bibliothèque universelle de Genève») lui assurent une renommée qui dépasse les frontières du canton. C'est ainsi que l'un de ses chefs-d'oeuvre, La Bibliothèque de mon oncle, lui attire des lecteurs célèbres: Joseph de Maistre en France, Alexandre Vinet à Bâle, Heinrich Zschokke à Aarau lequel traduira en allemand les Genfer Novellen, attribuant par là un nom aux «Nouvelles genevoises». Tpffer publie aussi les trois premiers albums en estampes: «M. Jabot, M. Crépin, M. Vieux-Bois», rapidement contrefaits à Paris, ce qui le navre, et le rend très prudent dans la distribution des exemplaires des récits des «Voyages» qu'il entreprend une ou deux fois par an avec ses élèves. Cette vie très remplie se trouve explicitée par les lettres qu'édite Jacques Droin, lesquelles font également la part belle à sa femme et à ses trois enfants.